Protein–RNA interactions for Protein: Q9R069

Bcam, Basal cell adhesion molecule, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcamQ9R069 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BcamQ9R069 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BcamQ9R069 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms