Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Npas3Q9QZQ0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Npas3Q9QZQ0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Npas3Q9QZQ0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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