Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYB1

Clic4, Chloride intracellular channel protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic4Q9QYB1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clic4Q9QYB1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms