Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Opn4Q9QXZ9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Opn4Q9QXZ9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms