Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ6

Slco1a1, Solute carrier organic anion transporter family member 1A1, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1a1Q9QXZ6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Slco1a1Q9QXZ6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms