Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rad18Q9QXK2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rad18Q9QXK2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms