Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Homer2Q9QWW1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Homer2Q9QWW1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms