Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rai2Q9QVY8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms