Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc2lQ9JME7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc2lQ9JME7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms