Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA7

Cyp3a41a, Cytochrome P450 3A41, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms