Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

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Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prg4Q9JM99 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Prg4Q9JM99 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Prg4Q9JM99 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prg4Q9JM99 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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