Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SrfQ9JM73 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms