Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmgn5Q9JL35 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hmgn5Q9JL35 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms