Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chrac1Q9JKP8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms