Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms