Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scamp5Q9JKD3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms