Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Riox1Q9JJF3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Riox1Q9JJF3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Riox1Q9JJF3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Riox1Q9JJF3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Riox1Q9JJF3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Riox1Q9JJF3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Riox1Q9JJF3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Riox1Q9JJF3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Riox1Q9JJF3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Riox1Q9JJF3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Riox1Q9JJF3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Riox1Q9JJF3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Riox1Q9JJF3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Riox1Q9JJF3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Riox1Q9JJF3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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