Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET77

Jph3, Junctophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph3Q9ET77 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jph3Q9ET77 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Jph3Q9ET77 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Jph3Q9ET77 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Jph3Q9ET77 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms