Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET54

Palld, Palladin, mousemouse

Predictions only

Length 1,408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PalldQ9ET54 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PalldQ9ET54 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PalldQ9ET54 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms