Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap29Q9ERB0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap29Q9ERB0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap29Q9ERB0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap29Q9ERB0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap29Q9ERB0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snap29Q9ERB0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snap29Q9ERB0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snap29Q9ERB0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snap29Q9ERB0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snap29Q9ERB0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Snap29Q9ERB0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snap29Q9ERB0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snap29Q9ERB0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snap29Q9ERB0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snap29Q9ERB0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms