Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RhojQ9ER71 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RhojQ9ER71 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms