Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Scn4aQ9ER60 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Scn4aQ9ER60 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms