Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tlr9Q9EQU3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tlr9Q9EQU3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms