Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rhox9Q9EQM5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rhox9Q9EQM5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms