Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf8Q9EQH4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf8Q9EQH4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms