Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trmt112Q9DCG9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trmt112Q9DCG9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms