Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Rnf6Q9DBU5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf6Q9DBU5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms