Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smg9Q9DB90 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Smg9Q9DB90 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Smg9Q9DB90 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Smg9Q9DB90 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Smg9Q9DB90 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Smg9Q9DB90 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Smg9Q9DB90 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smg9Q9DB90 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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