Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smdt1Q9DB10 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Smdt1Q9DB10 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms