Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9L5

Actrt2, Actin-related protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt2Q9D9L5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Actrt2Q9D9L5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms