Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H8

UPF0565 protein C2orf69 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9H8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D9H8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D9H8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D9H8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Q9D9H8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9H8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9H8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9H8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms