Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg7Q9D906 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg7Q9D906 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms