Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmigd1Q9D7L8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmigd1Q9D7L8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms