Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2310002L09RikQ9D7L5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2310002L09RikQ9D7L5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms