Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Nop56Q9D6Z1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Nop56Q9D6Z1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nop56Q9D6Z1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Nop56Q9D6Z1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Nop56Q9D6Z1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Nop56Q9D6Z1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Nop56Q9D6Z1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Nop56Q9D6Z1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Nop56Q9D6Z1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Nop56Q9D6Z1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nop56Q9D6Z1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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