Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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Rab11fip1Q9D620 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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Rab11fip1Q9D620 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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Rab11fip1Q9D620 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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Rab11fip1Q9D620 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Rab11fip1Q9D620 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Rab11fip1Q9D620 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Rab11fip1Q9D620 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab11fip1Q9D620 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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