Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lpcat2bQ9D5U0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lpcat2bQ9D5U0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms