Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Speer4f1Q9D5Q6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Speer4f1Q9D5Q6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms