Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
4930449I24RikQ9D5E3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms