Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Zcchc13Q9D548 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Zcchc13Q9D548 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms