Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc105Q9D4K7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc105Q9D4K7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms