Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Phf6Q9D4J7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Phf6Q9D4J7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms