Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.05■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Clvs1Q9D4C9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Clvs1Q9D4C9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms