Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms