Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
4933428M09RikQ9D3X3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms