Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klhdc8bQ9D2D9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms