Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H6

Ndufaf4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf4Q9D1H6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ndufaf4Q9D1H6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ndufaf4Q9D1H6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms