Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Q9D1F3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D1F3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D1F3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D1F3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms