Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem53Q9D0Z3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms