Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ift27Q9D0P8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ift27Q9D0P8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms